Tema 5 Exercicis (2010)

Ejercicio Catalán
Universidad Universidad Autónoma de Barcelona (UAB)
Grado Ciencias Ambientales - 3º curso
Asignatura Genètica ambiental
Año del apunte 2010
Páginas 3
Fecha de subida 31/08/2014
Descargas 0
Subido por

Vista previa del texto

5.1. Descomposició de la diversitat gènica dins i entre poblacions. Calcula HS, HT, DST i GST.
Locus PGI‐2 G6PD‐1 G6PD‐2 PGM LGGP‐1 Allele a b a b a b a b c a b Woodridge Litchfield Binghamton New Lebanon 0,68 1,00 1,00 0,75 0,32 0,00 0,00 0,25 0,93 0 93 1 1,00 00 0 0,82 82 0 0,91 91 0,07 0,00 0,18 0,09 1,00 1,00 0,50 1,00 0,00 0,00 0,50 0,00 0,00 0,00 0,50 0,00 0,86 1,00 0,50 1,00 0,14 0,00 0,00 0,00 0,50 0,50 1,00 1,00 0,50 0,50 0,00 0,00 PROMIG 0,86 0,14 0 0,92 92 0,09 0,88 0,13 0,13 0,84 0,04 0,75 0,25 Woodridge Litchfield Binghamton New Lebanon 0,43520 0,00000 0,00000 0,37500 0,13020 0,00000 0,29520 0,16380 0,00000 0,00000 0,50000 0,00000 0,24080 0,00000 0,50000 0,00000 0,50000 0,50000 0,00000 0,00000 0,26124 0,10000 0,25904 0,10776 , HS 0,18201 PROMIG 0,24439 0,15555 0,21875 0,27755 0,37500 Per a l'exercici 5.2: PROMIG/W PROMIG/L PROMIG/B PROMIG/N 0,92 0,81 0,81 0,89 0,08 0,19 0,19 0,11 0 0,91 91 0 0,89 89 0 0,95 95 0 0,92 92 0,09 0,11 0,05 0,08 0,83 0,83 1,00 0,83 0,17 0,17 0,00 0,17 0,17 0,17 0,00 0,17 0,83 0,79 0,95 0,79 0,00 0,05 0,05 0,05 0,83 0,83 0,67 0,67 0,17 0,17 0,33 0,33 m H esp  1   p i2 i 1 Locus PGI‐2 G6PD‐1 G6PD‐2 PGM LGGP‐1 Hesp PROMIG DST  HT  HS GST  DST HT 0,07224 0,28412 28,41 % HT 0,25425 Per a l'exercici 5.2: PROMIG/W PROMIG/L PROMIG/B PROMIG/N 0,15278 0,30780 0,30780 0,19058 0,16380 0,20098 0,10098 0,15278 0,27778 0,27778 0,00000 0,27778 0,27778 0,35120 0,08898 0,35120 0,27778 0,27778 0,44444 0,44444 HT/k 0,22998 0,28311 0,18844 0,28336 5.2. Contribució de cada població a la diversitat genètica total. Calcula C(k), CS(k) i CD(k) de cada població.
Diversitat HT Woodridge Litchfield Binghamton New Lebanon 0,25425 0,25425 0,25425 0,25425 HT/k 0,22998 9,54 0,28311 ‐11,35 0,18844 25,88 0,28336 ‐11,45 HS 0,18201 0,18201 0,18201 0,18201 HS/k 0,15560 0,20935 0,15633 0,20676 10,39 10,75 ‐10,75 10,10 9,73 ‐9,73 DST 0,07224 0,07224 0,07224 0,07224 DST/k = HT/k ‐ HS/k 0,07438 0,07376 0,03211 0,07660 ‐0,84 ‐0,60 15,78 ‐1,71 C(k) CS((k)) CD(k) % % % C (k )  HT  HT / k HT CS (k )  HS  HS /k HT C D (k )  DST  DST / k HT C (k )  C S (k )  C D (k ) 5.3. Distàncies genètiques de Nei entre les poblacions. Calcula DN entre totes les poblacions a parells.
m ( p Woodridge Litchfield Binghamton New Lebanon 0 0,56480 56480 1 1,00000 00000 1 1,00000 00000 0 0,62500 62500 0,86980 1,00000 0,70480 0,83620 1,00000 1,00000 0,50000 1,00000 0,75920 1,00000 0,50000 1,00000 0,50000 0,50000 1,00000 1,00000 0,73876 0,90000 0,74096 0,89224 W‐L i1 Locus PGI‐2 PGI 2 G6PD‐1 G6PD‐2 PGM LGGP‐1 PROMIG m p 2 ix DN   ln( I N ) Distància genètica de cada població respecte les altres tres: Woodridge Litchfield Binghamton New Lebanon Woodridge 0,02660 0,24855 0,06535 Litchfield 0,02660 0,20689 0,07423 Binghamton 0,24855 0,20689 0,14622 New Lebanon 0,06535 0,07423 0,14622 PROMIG 0,11350 0,10257 0,20055 0,09527 piy ) W‐B 0 0,68000 68000 0,93000 1,00000 0,86000 0,50000 0,79400 m Woodridge Woodridge Litchfield Binghamton New Lebanon Litchfield Binghamton New Lebanon 0,97375 0,77993 0,93674 0,02660 0,81311 0,92846 0,24855 0,20689 0,86396 0,06535 0,07423 0,14622 ix i1 IN  (p i 1 ix piy ) m m i 1 i 1 ( pix2 )( piy2 ) W‐N 00,68000 68000 0,77520 0,50000 0,43000 0,50000 0,57704 L‐B 00,59000 59000 0,85260 1,00000 0,86000 0,50000 0,76052 L‐N 11,00000 00000 0,82000 0,50000 0,50000 0,50000 0,66400 B‐N 00,75000 75000 0,91000 1,00000 1,00000 0,50000 0,83200 00,75000 75000 0,76240 0,50000 0,50000 1,00000 0,70248 ...