Entrega 2 Genètica molecular (2015)

Ejercicio Español
Universidad Universidad Autónoma de Barcelona (UAB)
Grado Biología - 2º curso
Asignatura genètica molecular
Año del apunte 2015
Páginas 2
Fecha de subida 08/02/2015
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Entrega 2 Genètica molecular del curs 2013/14

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ENTREGA 2 GENETICA MOLECULAR 1-True/False 1. DNA synthesis during replication is initiated from RNA primers. T 2. DNA polymerases require both a template and a primer to initiate synthesis of new DNA. T 3. DNA ligase forms covalent phosphodiester bonds between adjacent nucleotides. F 4. The “end replication problem” is not relevant for the leading DNA strand. F 5. The proofreading function of DNA polymerases involves 5′à 3′ exonuclease activity. F 6. DNA polymerases always synthesize new DNA by adding nucleotides on to the 5′ phosphate. F 7. Okazaki fragments are involved in both lagging and leading DNA strand synthesis. F 8. Telomerase uses an inherent RNA template to synthesize new DNA. T 9. DNA primase requires only a DNA template to initiate RNA primer synthesis. F 10. Theta replication utilizes a unidirectional replication fork. F 11. Both eukaryotes and prokaryotes typically have only one origin of replication. F 12. Rolling-circle replication is unidirectional. T 13. Telomeres are tandemly repeated DNA sequences located at the ends of eukaryotic chromosomes. T 14. During replication in eukaryotes, nucleosomes dissociate and are re-formed entirely from newly synthesized histones. F 15. Single-strand-binding proteins prevent DNA polymerase from entering a replication initiation site. T 16. DNA ligase joins Okazaki fragments together. T 17. Meselson and Stahl showed that DNA is replicated by a conservative system. F 18. Eukaryotic cells use the same DNA polymerase to replicate mitochondrial, chloroplast, and nuclear DNA. F 2-Multiple Choice 31. Which one of the following statements is not true for all E. coli DNA polymerases? Explain why the statement is not true.
a. They can synthesize any sequence specified by a template strand.
b. They require a primer to initiate synthesis.
c. They use dNTPs to synthesize new DNA.
d. They produce newly synthesized strands that are complementary and antiparallel to the template strands.
e. They possess 5′ à 3′ exonuclease activity.
f. They synthesize in the 5′ à 3′ direction by adding nucleotides to a 3′-OH group.
g.Tyrosin recombinases cut at the same times the four DNA strands during the recombination process.
Falsa, la Tirosina recombinasa no rompe las cuatro hebras a la vez, al principio rompe una hebra de cada molécula de ADN, para a continuación unirse y, finalmente, romper este enlace para dejar que las hebras rotas forme una unión de Holliday. Posteriormente hace lo mismo con las otras dos hebras.
h. Transposases recognize are enzymes involved in LTR elements transposition.
3. Why did the Meselson and Stahl experiment require two rounds of replication? El experimento de Meselson y Stahl se basó en la presencia de nitrogeno en el ADN y en la existencia de dos isótopos de éste, 14N y 15N, que pueden ser diferenciados mediante técnicas experimentales a causa del mayor peso del 15N.
El experimento consistió en el cultivo de varias generaciones de E. coli, una cepa en un medio con 15N y otra en un medio con 14N. Cuando se extrajo el ADN de ambas cepas y se centrifugó, se obtuvieron dos patrones, el de 15N más pesado que el de 14N. A continuación se puso en un medio 14N la cepa que había sido cultivada en un medio 15N y se permitió un ciclo de replicación. El resultado tras extraer el ADN y centrifugarlo fue una banda que era justo la media de las bandas de las cepas anteriores, esto demostró que la replicación no era conservadora.
Para diferenciar ahora si la replicación era dispersante o semiconservativa, se puso la cepa cultivada en 15 N en un medio con 14N y se realizaron dos ciclos de replicación. Tras extraer el ADN y analizarlo se obtuvieron bandas que eran iguales a las del experimento anterior y bandas que coincidían con el ADN de las células que se habían cultivado en un medio exclusivo de 14N. Esto nos indica que la replicación es semiconservativa, porque si fuera dispersante nunca se habrían obtenidos bandas con el mismo peso que las bandas de ADN con 14N exclusivamente, ya que la replicación dispersiva mantendría restos de 15N después de tan sólo dos replicaciones.
Con esto podemos decir que se necesitaron dos ciclos de replicaciones para poder descartar una de las dos posibles teorías sobre la replicación que quedaban después del primer experimento.
4. You are studying two new viruses with DNA genomes of 12 Kb. Both viruses can synthesize DNA at a rate of 400 nucleotides per second. The first virus uses rolling-circle replication, whereas the second uses theta replication. How long will each take to replicate its genome? En el caso del primer virus, que usa el modelo del circulo rodante, la replicación de su DNA va a tardar 60s (2x12000b/(400b·s)), porqué primero se replica sobre una cadena molde y después sobre la otra. Y en el caso del segundo virus, que usa la replicación "theta", el tiempo será la mitad, 30s, ya que las dos cadenas moldes serán replicadas al mismo tiempo.
5. Matching. Match each letter with the most appropriate letter choice: 25. photoreactivation 26. transversion 27. alkylation 28. intercalating agent 29. xeroderma pigmentosum 30. gain-of-function mutant 31. ultraviolet light 32. transition 33. trinucleotide repeats 34. suppressor mutation           G.- Direct repair F.- AT à CG I.- ethylmethyl sulfonate J Ethidium bromide e.- dominant H.- intragenic or intergenic A.- Pyrimidine dimers C.- AT à GC D.- Fragile-X syndromeD B.- Nucleotide-excision repair 6. You have a strain of bacteria that is defective for DNA glycosylase activity. You expose one culture of this strain to EMS and the other to cisplatin (a chemotherapy drug that creates bulky adducts on purine bases). You notice that the cisplatin is much more toxic to this strain of bacteria. Explain your observation.
Observamos que la cisplatina es más tóxica en esta cepa de bacterias porque los daños que produce en las bases purínicas suelen ser reparados por el método de la reparación de escisión de bases. Si esta cepa tuviera actividad DNA glicosilasa podría reparar los daños en sus bases y reducir la toxicidad de la cisplatina, pero como la tiene defectuosa, la bacteria no puede reparar los daños en las base purínicas y el cúmulo de daños desencadena la apoptosis celular.
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