3.2. Genoma vírico (2017)

Apunte Español
Universidad Universidad Rovira y Virgili (URV)
Grado Biotecnología - 4º curso
Asignatura Virologia
Profesor D.C.
Año del apunte 2017
Páginas 2
Fecha de subida 22/10/2017
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GENOMA VÍRICO. TEMA 3, PARTE 2. Genoma hasta un millón de bases. Presentan variabilidad inmensa entre las diferentes familias víricas. Además, pueden ser genomas enteros (una sola molécula contiene todo el genoma), genomas partidos (varias moléculas se encuentran en varios viriones como Gemini virus: cápsidas complejas que consisten en cápsidas unidas entre ellas), genomas segmentados (varias moléculas de ácido nucleico). También existen virus de genoma incompleto (generalmente afectan a vegetales, no tienen toda la información necesaria para multiplicarse, es decir, les falta algún gen). La función vendrá dada por otro virus, por lo que sólo acaban su ciclo de vida en células co-infectadas. Según la arquitectura génica, encontramos la clasificación de Baltimore à 7 clases Grupo I. dsDNA Grupo II. ssDNA à dsDNA Grupo III. dsRNA à helicasa separa à RNA + y RNA - à el + es el mensajero Grupo IV. ssRNA+ à mensajero à traducción Grupo V. ssRNA- à ssRNA+ à mensajero Grupo VI. ssRNA-RT à híbrido DNA-RNA Grupo VII. dsDNA-RT à RNA à DNA Algunos virus muestran restricciones en cuanto a la infección - Virus sin receptor de superficie o factores intracelulares para el huésped - Limitación tamaño del genoma - Competencia con factores celulares Los virus llevan a cabo sus funciones con la mínima cantidad de genoma gracias a la policistronía: si cada mRNA da lugar a más de una proteína nos ahorramos los elementos reguladores a nivel del DNA. Diferentes estrategias: 1. Codificar poliproteínas. mRNA à proteína con regiones reconocidas por proteasas celulares à escisión à obtención de diversas proteínas a. Necesidad de región CAP para que se de la traducción b. Gran número de factores de transcripción que reconocen la secuencia consenso de Kozak 2. Algunos virus no presentan la secuencia consenso, ya que su mRNA presenta estructuras 3D llamadas Internal Ribosomal Entry Sites ‘IRES’. Éstas permiten que el ribosoma comience la traducciwón en cada uno de estos lazos. 3. Señales START-STOP situadas en el DNA muy cerca la una de la otra, de forma que la polimerasa cuando empieza a sintetizar el mensajero, va transcribiendo hasta que encuentra el STOP. Puede que se pare dando lugar a una proteína, o puede que la encuentre pero que salte a la de START por estar tan cerca, dando lugar a un mRNA que será traducido. a. Probabilidad del salto: 1/3 aprox b. Al inicio estarán los genes que se necesitan en más cantidad, para así tener mayor probabilidad de ser traducidos 4. Splicing alternativo. Las diferencias en la transcripción hacen que los virus tengan polimerasas específicas - DNA polimerasa DNA dependiente: las de células eucariotas. Replicación del DNA utilizando de molde DNA - RNA polimerasa DNA dependiente: pasa de DNA a RNA, en las células - DNA polimerasa RNA dependiente: copias de DNA a partir de RNA - RNA polimerasa RNA dependiente: replicación del RNA Todas las polimerasas comparten características estructurales y secuencias altamente conservadas, sobre todo en las regiones enzimáticamente activas, con el fin de reconocer los diferentes ácidos nucleicos. VIRUS DE RNA - RNA à RNA. RNAp-RNAd o RNA polimerasa dependiente de RNA - RNA à DNA. DNAp-RNAd o DNA polimerasa dependiente de RNA à transcriptasa inversa Virus ssRNA- y dsRNA. Su genoma desproteinizado no es infectivo. El primer evento que tiene lugar es la transcripción. - Los – siempre transportan una polimerasa de tipo RNAp-RNAd para evitar que la célula degrade el RNA simple - En los de de doble cadena necesitamos la helicasa de RNA Virus ssRNA+. El ácido nucleico es el mRNA, por lo que será traducido. Por este motivo, su genoma desproteinizado ya es infectivo. Una de las proteínas que codifica su genoma es una polimerasa de RNA Los virus de RNA necesitan otras proteínas para la replicación/transcripción. - Proteínas de localización. Direccionan el RNA al compartimento en el que se llevará la cabo su replicación à al núcleo, a vesículas… - Helicasas de RNA. Evitan la formación de estructuras secundarias en la cadena molde, así como la formación de híbridos entre la cadena madre y la de nueva síntesis o Diana para el virus de la hepatitis C - Proteínas estimuladoras/reguladoras de RNAPs. La disrupción de proteínas con RNAP da lugar a defectos en la síntesis de RNA. ...

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